Experiencia de investigación de verano para estudiantes universitarios financiada por la NSF

Investigador principal: Dr. Mohamed K Zobaa

Coinvestigadores: Dylan Robinson, Benjamín Muñoz, Traejen Sánchez

Duración del proyecto: junio de 2023 - mayo de 2024

Resumen de la investigación: El objetivo de este proyecto es realizar un estudio palinológico detallado para identificar y establecer un bioevento estratigráfico importante en la cuenca de Yola, Nigeria, y correlacionarlo con lo que se ha identificado recientemente en el noreste de África (Egipto) y más allá. El objetivo principal es resolver las etapas fusionadas del Cretácico Superior y establecer una base sólida para la separación de fronteras entre ellas en África. Este es un importante problema palinoestratigráfico del Cretácico Superior que dificulta la capacidad de proporcionar esquemas sólidos de palinozonización de datación por edad en importantes cuencas y provincias productoras de petróleo, como las cuencas de Yola y Gongola en el norte de Benue Rift, Nigeria, y el desierto noroccidental y el golfo de Suez. provincias de Egipto. El problema se debe principalmente a la falta de fósiles de diagnóstico (índice) de edad que puedan separar de manera confiable e indudable las etapas del Cretácico Superior. Un trabajo reciente y en curso ha identificado bioeventos tempranos de Pediastrum específicos de Coniacian en Egipto que son muy prometedores para resolver este problema. Buscamos identificar el mismo Bioevento y establecerlo como el primer marcador bioestratigráfico reconocible y correlacionable para el Coniaciano temprano dentro de la Cuenca de Yola en particular y en África Occidental en general.

Investigadora principal: Athenia Oldham

Coinvestigadores: Hannah Ware, Sebastián Pérez, Douglas Henderson

Duración del proyecto: julio de 2023 - junio de 2024

Resumen de la investigación: El objetivo de este proyecto es validar los resultados de la secuenciación del metagenoma mediante la identificación y amplificación de objetivos genéticos involucrados en la formación de biopelículas y/o la detección de quórum. La metodología incluye minería de datos, diseño de cebadores, PCR, electroforesis en gel y secuenciación de ADN. Los estudiantes deberían poder identificar un subconjunto de genes involucrados en estos dos procesos y validar su presencia en los genomas de organismos seleccionados mediante PCR.

Investigador Principal: John Garza

Coinvestigadores: Swetha Kesavan

Duración del proyecto: julio de 2023 - junio de 2024

Resumen de la investigación: Fumar antes o después de una lesión cerebral traumática (TBI) se asocia con una recuperación disminuida. Los datos sobre el impacto del tabaquismo en la mortalidad a corto plazo de pacientes con lesiones críticas por TCE no son concluyentes. Utilizamos registros de hospitalización disponibles públicamente, a nivel estatal y no identificados para estudiar pacientes de trauma y emergencia de ≥18 años, con un diagnóstico principal de un encuentro inicial por TCE ingresados ​​en hospitales de cuidados intensivos en Texas entre 2016 y 2021. El tabaquismo se identificó mediante la Clasificación Internacional. de Enfermedades, Décima Revisión, Modificación Clínica (CIE-10-CM). Se identificó un diagnóstico principal de TBI utilizando códigos ICD-10-CM seleccionados de la categoría refinada del software de clasificación clínica INJ008, lesión cerebral traumática (TBI); conmoción cerebral, encuentro inicial. Tres modelos estimaron la asociación entre el tabaquismo y la mortalidad hospitalaria. La regresión logística multinivel con ajuste de propensión fue el enfoque de análisis principal con emparejamiento por puntaje de propensión y regresión logística multivariable sin emparejamiento por puntaje de propensión aplicado como análisis alternativos. Se completaron análisis adicionales para subgrupos de pacientes, categorizaciones de hospitalizaciones y para el resultado secundario de mortalidad a corto plazo. El tabaquismo se asoció con una menor mortalidad hospitalaria y a corto plazo en pacientes de urgencias y traumatismos con un diagnóstico principal de contacto inicial por TCE. Los estudios que exploran los mecanismos que conducen a estos hallazgos pueden mejorar la comprensión de los impactos del tabaquismo en la mortalidad después de una lesión cerebral traumática.

Investigador Principal: John Garza

Co-investigadores: Jessica Villareal

Duración del proyecto: julio de 2023 - junio de 2024

Resumen de la investigación: Fumar se asocia con una menor esperanza de vida y los pacientes con antecedentes de tabaquismo tienen un mayor riesgo de contraer COVID-19. La investigación sobre el impacto pronóstico del tabaquismo en pacientes con COVID-19 no es concluyente. Utilizamos registros de hospitalización disponibles públicamente, a nivel estatal y no identificados para estudiar a pacientes de ≥18 años con un diagnóstico de COVID-19 ingresados ​​en hospitales de cuidados intensivos en Texas desde el segundo trimestre de 2 hasta el primer trimestre de 2020. Los pacientes con antecedentes de tabaquismo se identificaron mediante el uso de registros internacionales. Clasificación de Enfermedades, Décima Revisión, Códigos de Modificación Clínica (ICD-1-CM). Las hospitalizaciones con diagnóstico de COVID-2022 se identificaron mediante el código U10 de la CIE-19-CM. Tres modelos estimaron la asociación entre antecedentes de tabaquismo y mortalidad a corto plazo. La regresión logística multinivel con ajuste de propensión fue el enfoque de análisis principal con emparejamiento por puntaje de propensión y regresión logística multivariable sin emparejamiento por puntaje de propensión aplicado como análisis alternativos. Se completaron análisis adicionales para subgrupos de pacientes, categorías de hospitalizaciones y para el resultado secundario de mortalidad hospitalaria. Fumar se asoció con un menor riesgo de mortalidad hospitalaria y a corto plazo en pacientes hospitalizados con diagnóstico de COVID-10. Estudios adicionales que exploren los mecanismos específicos que conducen a estos hallazgos inesperados pueden dar como resultado una mejor comprensión de los impactos del tabaquismo en el proceso de la enfermedad de COVID-071.

Investigador principal: Mario Kiran

Co-investigador: Sami Ahamed

Duración del proyecto: julio de 2023 - junio de 2024

Enfoque de la investigación: El diseño en áreas residenciales y en la industria varía de varias maneras. Los muebles se pueden diseñar con varios materiales, incluidos madera, acero, plástico, etc. Los muebles están diseñados para cumplir un propósito y la necesidad de tener el diseño de muebles adecuado es garantizar que se satisfaga una necesidad. Diseñar muebles ergonómicos que ayuden a aquellas personas con problemas de espalda y rodillas a poder utilizar los muebles sin mucho esfuerzo.

ESTUDIANTES DE INVESTIGACIÓN

Dylan Robinson
Enfoque de la investigación: Dylan examinó microscópicamente portaobjetos palinológicos en luz transmitida para identificar, contar puntos y fotografiar muestras de interés.

Antecedentes: Dylan Robinson es estudiante de segundo año en Midland College. Está planeando obtener una licenciatura en geología de la Cuenca Pérmica de la Universidad de Texas.

Contacto: dr97164@gmail.com

 

Benjamín Muñoz
Enfoque de la investigación: Ben examinó microscópicamente portaobjetos palinológicos con luz transmitida para identificar, contar puntos y fotografiar muestras de interés.

Antecedentes: Benjamín Muñoz es estudiante de último año de geología en la Universidad Estatal Sul Ross.

Contacto: bemunoz02@gmail.com 

 

Hannah artículos
Enfoque de la investigación: Hannah diseñó varios conjuntos de cebadores para amplificar genes implicados en la formación de biopelículas.

Antecedentes: Hannah Ware es estudiante de tercer año en la Universidad de Oklahoma. Ella planea asistir a la escuela de odontología después de graduarse.

Contacto: hannahware02@gmail.com

Swetha Kesavan
Enfoque de la investigación: Swetha revisó los códigos de la CIE-10-CM y ayudó con la derivación de cohortes y el análisis formal.

Antecedentes: Swetha Kesavan es estudiante de segundo año en la Universidad Rice con especialización en Bioestadística.

Contacto: snk6@rice.edu

Jessica Villarreal
Enfoque de la investigación: Jessica Villareal revisó códigos para los códigos ICD-10-CM y ayudó con la derivación de cohortes, el análisis formal y la revisión de la literatura.

Antecedentes: Jessica Villarreal es estudiante de tercer año en UT-Permian Basin con especialización en Biología.

Contacto: villareal_j52368@utpb.edu 

sami ahmed
Enfoque de la investigación: Sami trabajó en un concepto para diseñar muebles que soportaran la altura y el peso de una persona y que pudieran adaptarse al soporte lumbar de la espalda, los muslos y las piernas de una persona para mantener la mejor postura para el lugar de trabajo o un entorno informal. El mobiliario (silla) contará con los complementos necesarios como escritorio, brazos oscilantes y respaldo reclinable.

Antecedentes: Sami Ahmed es estudiante de último año en Odessa College. Está planeando obtener una licenciatura en Ciencias de la Computación de la Universidad de Texas Permian Basin.

Contacto: ssamiusa3@gmail.com

ESTUDIANTES DE INVESTIGACIÓN

Aubrey González Antecedentes:  Contacto: gbree627@gmail.com

Salma Zobaa Antecedentes:  Contacto: zobaasalma@gmail.com

Título de la investigación: Impacto de los parámetros clave de fracturación en la producción de petróleo y gas en pozos horizontales

El objetivo de este proyecto es analizar pozos horizontales fracturados hidráulicamente en la cuenca de University Lands de Midland, con un enfoque en los condados de Regan, Martin y Andrews, con el objetivo de desarrollar estrategias para utilizar estas tierras de manera más efectiva. Hemos recopilado varios datos de pozos horizontales en los condados especificados, incluida la profundidad vertical total, la longitud horizontal total, el número de etapas de fractura, la arena de fractura total, el agua de fractura total y otra información relevante. Los condados se han dividido en regiones del norte (Martin y Andrews) y del sur (Regan) para el análisis comparativo. Actualmente, los datos recopilados están en proceso de análisis y traducción a gráficos y otras representaciones visuales para fines de presentación. En el futuro, finalizaremos y analizaremos los datos para sacar conclusiones sobre cómo hacer un uso más efectivo de University Lands.

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ESTUDIANTES DE INVESTIGACIÓN

Dylan Hernández Antecedentes:  Contacto: dylanaaronhernandez003@gmail.com

Valeria León Antecedentes:  Contacto: v1040604@gmail.com

Título de la investigación: Sistema de filtración a pequeña escala de agua producida de pozos de petróleo

Este proyecto tiene como objetivo crear un sistema de filtración a pequeña escala para aliviar la escasez de agua. Sin embargo, trabajar con agua producida tiene limitaciones significativas, como niveles elevados de sales, metales, compuestos orgánicos y elementos radiactivos que los sistemas de tratamiento de agua convencionales no pueden tratar. Nuestro objetivo es diseñar el sistema de tratamiento de agua y estudiar las muestras de agua producida antes y después de la filtración. Estudiamos la literatura sobre el tratamiento de agua con luz ultravioleta utilizando espuma fototérmica para comprender la materia particulada específica con la que estábamos trabajando; el grupo trabajó en diversos diseños de sistemas de filtración utilizando software no convencional, como hojas de planificación de Excel y Microsoft Word. Luego, nuestro grupo agitó diferentes concentraciones de carbón activado en un volumen fijo de agua producida para evaluar su tasa de absorción. Cuando las muestras terminaron de sedimentarse, las muestras de agua producida y carbón activado pasaron por una membrana de microfiltro para medir la tasa de absorción entre cada muestra y encontrar qué concentración de carbón activado con agua producida nos brinda la mayor cantidad de agua y la menor cantidad de sólidos disueltos totales.

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ESTUDIANTES DE INVESTIGACIÓN

Salina Vo Antecedentes:  Contacto: salina_vo@yahoo.com

Sofía Romero Antecedentes:  Contacto: sofiaromero263@yahoo.com

Título de la investigación: Validación de un estudio de metagenoma: en busca de genes implicados en la formación de biopelículas

El objetivo de este proyecto es validar los datos de la secuencia del metagenoma amplificando los genes implicados en la detección de quórum y la formación de biopelículas. En primer lugar, utilizamos la base de datos KEGG (https://www.genome.jp/kegg/) para identificar un subconjunto de genes asociados con estos dos procesos en Pseudomonas aeruginosa. A continuación, utilizamos la base de datos NCBI (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/) para diseñar dos conjuntos de cebadores para amplificar cada gen. A continuación, extrajimos ADN de las células bacterianas y cuantificamos el ADN mediante espectrometría UV. Desafortunadamente, nuestros cebadores no llegaron a tiempo para que interrogáramos a nuestros genes objetivo, por lo que la Dra. O nos proporcionó conjuntos de cebadores universales que su laboratorio utiliza rutinariamente para "identificar" bacterias aisladas del medio ambiente. Estos cebadores alternativos amplifican un gen que codifica el ARNr 16S, que está presente en todas las bacterias. La comparación de su secuencia con las de un repositorio de ARNr 16S y la identificación de la coincidencia más cercana permiten la clasificación taxonómica de bacterias desconocidas. Con los cebadores a mano, preparamos reacciones en cadena de la polimerasa (PCR) y analizamos el tamaño esperado de los productos de PCR mediante electroforesis en gel para completar la experiencia de investigación de verano. Si nuestros cebadores hubieran llegado a tiempo, los resultados habrían respaldado o refutado los datos de la secuencia del metagenoma, lo que habría proporcionado información sobre los mecanismos genéticos de estos procesos en las células bacterianas.

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RosAaliyah Olguin
Antecedentes: 
Contacto: olguin_r@utpb.edu

Título de la investigación: Reconstrucción paleoclimática del Holoceno basada en muestras de núcleos de lagos del desierto del noroeste de Egipto

Mi proyecto de investigación se centra en el análisis elemental y la datación por carbono 14 de muestras de dos núcleos recuperados de las paleocostas de dos lagos del desierto noroccidental de Egipto. Los datos generados nos ayudarán a comprender los cambios deposicionales y climáticos en esta zona durante los últimos miles de años. Actualmente estamos investigando cuántas sustancias orgánicas e inorgánicas se encuentran dentro de estos núcleos. Para lograrlo, se tomaron dos subconjuntos de muestras de cada uno de nuestros núcleos, un subconjunto de control que no ha sido tratado con HCl y un segundo subconjunto que ha sido acidificado con HCl. Utilizando un analizador elemental FlashSmart, pudimos medir la cantidad de CHNS encontrada en cada muestra. También estamos realizando un análisis XRF para medir las concentraciones de elementos adicionales.